打开AI，首先打开或者导入我们在R中绘制好的tSNE或UMAP散点图，如下图为三张组合UMAP：

为了后面的操作不发生误触或移位，首先在右侧属性调整面板中找到‘图层’，将我们导入图片所在的图层锁定，然后新建一个专门用于圈选的图层。下文的全部操作都在新图层中进行。

在左侧工具栏中找到铅笔工具，调整描边颜色为黑，直接鼠标左键长按拖拽鼠绘，即可绘制不规则曲线。当线段首尾即将闭合时，光标右下角会出现一个小圆圈，此时松开鼠标左键曲线就能够闭合，如下，我们在三张UMAP中用铅笔工具圈选出1b。

那么如果将实线变虚线呢？在右侧找到‘描边’，展开面板，勾选虚线即可。还可以通过下方调整虚线的长度及间隙宽度到自己满意为止。如果觉得线条的宽度不合适，也可以在粗细中调整pt。

完成圈选后，使用文字工具添加对应亚群标签，字体、字号等文本参数可以在字符属性面板中修改。

剩余相同的亚群标签我们直接复制，使用选择工具移动到合适位置即可。

多个cluster/亚群的不规则圈选方法也是相同的。我们分别在三张UMAP图中圈选出有2a/b/c/d、3a、4a的亚群，并添加对应标签，如下图：

最后添加指示箭头，先使用直线段工具先在目标位置绘制短直线。

使用选择工具选中上一步绘制的直线段，展开描边属性面板，在箭头选项中选择合适的箭头样式即可。

在这个图表中，还可以使用直线段+文字工具进行人类和小鼠的组别区分：

最终复现效果如下：

如果觉得黑色不够显眼，可以尝试将选区和文本修改为红色，如文首Fig1：

好啦，今天的分享就到这里！

参考文献

Wang, F., Ding, P., Liang, X. et al. Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level. Nat Commun 13, 3620 (2022).

Garcia-Alonso, L., Lorenzi, V., Mazzeo, C.I. et al. Single-cell roadmap of human gonadal development. Nature 607, 540–547 (2022).

*未经许可，不得以任何方式复制或抄袭本篇文章之部分或全部内容。版权所有，侵权必究。

基迪奥生物|专业定制测序服务

联系方式：020-39341079；service@genedenovo.com返回搜狐，查看更多